在回京师的路上，王锐思虑再三，最终还是将有人在神翼上暗中动了手脚之事密报给了朱由校。因为此事毕竟是非同小可，能在禁军的严密守护下神不知鬼不觉地就做了手脚，想来这幕后的黑手亦不简单，若是不查个水落石出又怎能令人放心？
朱由校闻报大怒，立刻将魏忠贤唤到驾前，严令他一回京师就即刻查明事情的真相，看看究竟是何人竟如此大胆，居然将黑手伸向了皇上，此事已与谋逆无异！
魏忠贤得知情况后亦是惶恐不已，立刻明白了事情的重要性。他也很想知道是何方神圣有这么大的胆子和能耐，所以当即派出了飞骑先行返回京师传喻钧命，东厂和锦衣卫得令后立时倾巢而出行动起来。
只可惜他们终究仍是晚了一步，当圣驾终于回宫时，得到的消息是皇上的贴身太监王炜不知何故突然服毒身亡。同时离奇死去的还有两个小黄门，二人的尸体是在宫后苑的荷花塘中被发现，身上没有发现任何的伤痕。
事情很显然与这三人有关，随之而来昨夜守护钦安殿的亲军首领谭超的证词也印证了这一点。可是继续查察的线索已然中断，朱由校怒不可遏，但除了将三人夷灭九族泄愤外也没有别的办法。倒霉的还有谭超，他与手下全部被拿入东厂的大狱严刑拷问。可他们确实是毫不知情，就算受遍了诸般酷刑也说不出个所以然来。
无奈之下此事只有暂时不了了之，王锐却留上了心，暗想这幕后的主使之人可说是神通广大，以他的所知除了魏忠贤外再想不出第二个人来。但从种种情况来看，此事显然非魏忠贤所为。这就不能不让人心生警惕了，看来朝廷这潭水确是太深太浑，远比想象的还要复杂得多。自己千万不能因暂时的得利而放松，“阶级斗争”的这根弦还是要时刻紧绷着才是！
虽然有这不愉快的小小插曲，但仍然不掩试飞大典的巨大成功。尽管这不是什么朝政与民生大事，可实现了自古以来人们就有的飞天之梦仍可说是惊世骇俗的事情，更何况这份功绩里还有着皇帝的一半？因此接下来百官朝贺万民欢庆，乃至于进行祭天祭祖都是顺理成章之事。
既然有这么大的功绩，自然少不了论功行赏。可是如何封赏既不宜皇帝一个人说了就算，也不宜交到朝堂上去由百官讨论，而是由皇帝和内阁辅臣们一起商量出个章程为宜。这是朝政要事的正规流程，只有照此办理才能减少很多不必要的麻烦，皇权与文臣集团的对抗性也正在于此。
第二日，朱由校就将信王、顾秉谦和黄立极等几位阁臣，还有魏忠贤、李永贞，王锐等召来，为的就是商讨封赏事宜。
朱由校一上来就开门见山地说道：“昨日的试飞大典诸公俱已参与，此事可称是开创了前人未有之伟业，朕心甚慰，对有功者自是不吝封赏，今日召诸公前来为的也正是这件事。呵呵，若论功劳，除朕之外自以王卿居首！诸公不妨说说，朕应该如何封赏为好呢？”
王锐见皇帝提到自己的名字，急忙起身恭敬侍立谦逊道：“神翼之事全赖皇上圣明与诸位大人的共同努力，锐万万不敢贪功！”
朱由校将手一挥笑道：“王卿不必谦虚，朕早已说过，仅凭敢第一个飞天之壮举，卿就堪称我大明第一勇士！朕虽非尧舜，但亦不是商纣无道昏君，如此之功岂有不赏之理？你且安心坐在一旁听着就是！”
王锐闻言暗叹一声，心说这个白痴皇帝其实本质也还不坏，只可惜从小就被耽误了，登基后又被魏忠贤和客氏蒙骗玩弄于股掌之上。若是自己穿越的时间能早个10年20年，他也未必就不是个可造之才。
他原本只将皇帝当作了接近接近信王的一个跳板，此刻见朱由校也算是有情有义，不由得微感歉意。当下不再多言，应诺一声退到一旁，默默地想着自己的心事。
顾秉谦作为首辅，此时自然应该第一个发表意见。他轻咳了两声欠身说道：“皇上所言极是，飞天一事既开创了前人未有之伟业，又大显了我大明之威风，当可令万民归心，四海臣服！王公子此一番功劳非小，正该重重封赏。以臣之见，可赐其进士出身，入翰林院编修，不知皇上以为如何？”
翰林院掌制诰、史册、文翰之事，考议制度，详正文书，备皇帝顾问，主官为翰林学士，下有侍读学士、侍讲学士、修撰、编修、检讨等官。明代规定一甲进士三人直接入翰林之制，状元授修撰（从六品），榜眼、探花授编修（正七品）。别看翰林院只是个五品的衙门，翰林官品秩甚低，却被视为清贵之选。自明代以后，大学士均出自翰林，“非翰林不入内阁”，翰林院已经成为培育高级文官的摇篮和涵养高层次学者的场所。